Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 4,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PKD1P98161 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PKD1P98161 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PKD1P98161 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PKD1P98161 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PKD1P98161 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PKD1P98161 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PKD1P98161 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PKD1P98161 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PKD1P98161 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PKD1P98161 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKD1P98161 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKD1P98161 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKD1P98161 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKD1P98161 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKD1P98161 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKD1P98161 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKD1P98161 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKD1P98161 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKD1P98161 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKD1P98161 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKD1P98161 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKD1P98161 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKD1P98161 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKD1P98161 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKD1P98161 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKD1P98161 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKD1P98161 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKD1P98161 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKD1P98161 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKD1P98161 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PKD1P98161 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKD1P98161 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKD1P98161 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKD1P98161 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKD1P98161 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKD1P98161 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKD1P98161 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PKD1P98161 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKD1P98161 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKD1P98161 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKD1P98161 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKD1P98161 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PKD1P98161 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKD1P98161 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKD1P98161 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKD1P98161 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms