Protein–RNA interactions for Protein: P84085

ARF5, ADP-ribosylation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF5P84085 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF5P84085 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF5P84085 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF5P84085 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF5P84085 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF5P84085 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF5P84085 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF5P84085 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF5P84085 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF5P84085 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF5P84085 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF5P84085 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF5P84085 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF5P84085 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF5P84085 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF5P84085 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF5P84085 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF5P84085 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF5P84085 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF5P84085 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF5P84085 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF5P84085 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF5P84085 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF5P84085 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF5P84085 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF5P84085 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF5P84085 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF5P84085 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF5P84085 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF5P84085 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF5P84085 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF5P84085 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF5P84085 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF5P84085 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF5P84085 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF5P84085 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF5P84085 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF5P84085 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF5P84085 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF5P84085 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF5P84085 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF5P84085 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF5P84085 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF5P84085 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF5P84085 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF5P84085 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF5P84085 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF5P84085 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF5P84085 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF5P84085 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF5P84085 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF5P84085 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF5P84085 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF5P84085 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF5P84085 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF5P84085 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF5P84085 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF5P84085 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF5P84085 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF5P84085 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF5P84085 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF5P84085 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF5P84085 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF5P84085 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF5P84085 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF5P84085 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF5P84085 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF5P84085 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF5P84085 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF5P84085 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF5P84085 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF5P84085 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF5P84085 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF5P84085 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF5P84085 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF5P84085 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF5P84085 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF5P84085 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF5P84085 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF5P84085 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF5P84085 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF5P84085 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF5P84085 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF5P84085 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF5P84085 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF5P84085 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF5P84085 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF5P84085 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF5P84085 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARF5P84085 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARF5P84085 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ARF5P84085 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARF5P84085 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARF5P84085 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARF5P84085 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARF5P84085 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARF5P84085 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARF5P84085 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARF5P84085 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARF5P84085 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms