Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELF3P78545 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ELF3P78545 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELF3P78545 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELF3P78545 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELF3P78545 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELF3P78545 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELF3P78545 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELF3P78545 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELF3P78545 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELF3P78545 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELF3P78545 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELF3P78545 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELF3P78545 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELF3P78545 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ELF3P78545 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ELF3P78545 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELF3P78545 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELF3P78545 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELF3P78545 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELF3P78545 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELF3P78545 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELF3P78545 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELF3P78545 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELF3P78545 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELF3P78545 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELF3P78545 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELF3P78545 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELF3P78545 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELF3P78545 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELF3P78545 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELF3P78545 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELF3P78545 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELF3P78545 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELF3P78545 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELF3P78545 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELF3P78545 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELF3P78545 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ELF3P78545 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELF3P78545 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELF3P78545 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELF3P78545 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELF3P78545 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELF3P78545 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELF3P78545 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELF3P78545 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELF3P78545 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELF3P78545 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELF3P78545 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELF3P78545 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELF3P78545 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELF3P78545 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELF3P78545 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELF3P78545 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELF3P78545 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELF3P78545 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELF3P78545 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELF3P78545 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELF3P78545 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELF3P78545 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELF3P78545 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELF3P78545 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELF3P78545 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELF3P78545 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELF3P78545 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELF3P78545 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELF3P78545 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELF3P78545 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELF3P78545 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELF3P78545 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELF3P78545 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELF3P78545 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELF3P78545 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELF3P78545 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ELF3P78545 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELF3P78545 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELF3P78545 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELF3P78545 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELF3P78545 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELF3P78545 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ELF3P78545 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELF3P78545 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ELF3P78545 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELF3P78545 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELF3P78545 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELF3P78545 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELF3P78545 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELF3P78545 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELF3P78545 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELF3P78545 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELF3P78545 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELF3P78545 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELF3P78545 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELF3P78545 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELF3P78545 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELF3P78545 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELF3P78545 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELF3P78545 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELF3P78545 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ELF3P78545 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms