Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P63121 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms