Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms