Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms