Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms