Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIK1P57059 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIK1P57059 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIK1P57059 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIK1P57059 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIK1P57059 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIK1P57059 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIK1P57059 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIK1P57059 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIK1P57059 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIK1P57059 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIK1P57059 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIK1P57059 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIK1P57059 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIK1P57059 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIK1P57059 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SIK1P57059 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIK1P57059 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIK1P57059 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIK1P57059 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIK1P57059 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIK1P57059 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIK1P57059 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIK1P57059 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIK1P57059 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIK1P57059 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIK1P57059 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SIK1P57059 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SIK1P57059 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIK1P57059 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIK1P57059 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SIK1P57059 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIK1P57059 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIK1P57059 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIK1P57059 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIK1P57059 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIK1P57059 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIK1P57059 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIK1P57059 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIK1P57059 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIK1P57059 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIK1P57059 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIK1P57059 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIK1P57059 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIK1P57059 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIK1P57059 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIK1P57059 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIK1P57059 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SIK1P57059 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIK1P57059 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIK1P57059 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIK1P57059 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIK1P57059 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIK1P57059 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIK1P57059 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIK1P57059 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIK1P57059 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SIK1P57059 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIK1P57059 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIK1P57059 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIK1P57059 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SIK1P57059 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SIK1P57059 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SIK1P57059 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SIK1P57059 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SIK1P57059 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SIK1P57059 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIK1P57059 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIK1P57059 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIK1P57059 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIK1P57059 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIK1P57059 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIK1P57059 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SIK1P57059 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SIK1P57059 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SIK1P57059 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SIK1P57059 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIK1P57059 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SIK1P57059 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIK1P57059 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIK1P57059 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIK1P57059 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SIK1P57059 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIK1P57059 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIK1P57059 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SIK1P57059 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SIK1P57059 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIK1P57059 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIK1P57059 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SIK1P57059 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SIK1P57059 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SIK1P57059 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SIK1P57059 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SIK1P57059 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SIK1P57059 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SIK1P57059 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SIK1P57059 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SIK1P57059 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SIK1P57059 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SIK1P57059 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms