Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP6P55212 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP6P55212 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP6P55212 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP6P55212 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP6P55212 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP6P55212 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP6P55212 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP6P55212 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP6P55212 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP6P55212 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP6P55212 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP6P55212 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP6P55212 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP6P55212 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP6P55212 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP6P55212 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP6P55212 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP6P55212 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP6P55212 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP6P55212 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP6P55212 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP6P55212 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP6P55212 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP6P55212 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP6P55212 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP6P55212 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP6P55212 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP6P55212 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP6P55212 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP6P55212 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP6P55212 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP6P55212 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP6P55212 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP6P55212 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP6P55212 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP6P55212 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP6P55212 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP6P55212 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP6P55212 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP6P55212 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP6P55212 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP6P55212 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP6P55212 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP6P55212 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP6P55212 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP6P55212 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP6P55212 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP6P55212 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP6P55212 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP6P55212 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP6P55212 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP6P55212 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP6P55212 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP6P55212 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP6P55212 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP6P55212 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP6P55212 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP6P55212 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP6P55212 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP6P55212 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP6P55212 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP6P55212 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP6P55212 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP6P55212 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP6P55212 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP6P55212 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP6P55212 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP6P55212 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP6P55212 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP6P55212 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP6P55212 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP6P55212 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP6P55212 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP6P55212 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP6P55212 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP6P55212 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP6P55212 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP6P55212 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP6P55212 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP6P55212 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP6P55212 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP6P55212 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP6P55212 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP6P55212 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP6P55212 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP6P55212 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP6P55212 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP6P55212 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP6P55212 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP6P55212 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP6P55212 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP6P55212 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP6P55212 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP6P55212 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP6P55212 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP6P55212 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP6P55212 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP6P55212 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASP6P55212 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms