Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms