Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTPAP49638 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTPAP49638 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTPAP49638 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTPAP49638 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTPAP49638 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTPAP49638 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTPAP49638 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTPAP49638 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTPAP49638 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTPAP49638 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTPAP49638 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTPAP49638 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTPAP49638 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTPAP49638 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TTPAP49638 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTPAP49638 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTPAP49638 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTPAP49638 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTPAP49638 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTPAP49638 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTPAP49638 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTPAP49638 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTPAP49638 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTPAP49638 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTPAP49638 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTPAP49638 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTPAP49638 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTPAP49638 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TTPAP49638 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTPAP49638 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTPAP49638 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTPAP49638 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTPAP49638 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTPAP49638 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTPAP49638 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTPAP49638 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTPAP49638 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTPAP49638 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTPAP49638 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TTPAP49638 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTPAP49638 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTPAP49638 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTPAP49638 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTPAP49638 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTPAP49638 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TTPAP49638 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTPAP49638 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTPAP49638 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTPAP49638 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTPAP49638 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTPAP49638 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTPAP49638 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTPAP49638 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTPAP49638 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTPAP49638 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTPAP49638 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTPAP49638 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTPAP49638 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTPAP49638 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTPAP49638 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTPAP49638 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TTPAP49638 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTPAP49638 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTPAP49638 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTPAP49638 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTPAP49638 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TTPAP49638 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TTPAP49638 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TTPAP49638 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TTPAP49638 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TTPAP49638 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TTPAP49638 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TTPAP49638 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TTPAP49638 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TTPAP49638 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TTPAP49638 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TTPAP49638 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TTPAP49638 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TTPAP49638 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TTPAP49638 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TTPAP49638 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TTPAP49638 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TTPAP49638 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TTPAP49638 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TTPAP49638 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TTPAP49638 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TTPAP49638 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TTPAP49638 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TTPAP49638 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TTPAP49638 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TTPAP49638 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TTPAP49638 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TTPAP49638 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TTPAP49638 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TTPAP49638 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TTPAP49638 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TTPAP49638 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TTPAP49638 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TTPAP49638 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
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