Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms