Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GRIA4P48058 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIA4P48058 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms