Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RECQLP46063 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RECQLP46063 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RECQLP46063 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RECQLP46063 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RECQLP46063 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RECQLP46063 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RECQLP46063 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RECQLP46063 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RECQLP46063 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RECQLP46063 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RECQLP46063 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RECQLP46063 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RECQLP46063 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RECQLP46063 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RECQLP46063 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RECQLP46063 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RECQLP46063 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RECQLP46063 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RECQLP46063 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RECQLP46063 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RECQLP46063 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RECQLP46063 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RECQLP46063 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RECQLP46063 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RECQLP46063 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RECQLP46063 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RECQLP46063 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RECQLP46063 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RECQLP46063 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RECQLP46063 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RECQLP46063 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RECQLP46063 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RECQLP46063 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RECQLP46063 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RECQLP46063 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RECQLP46063 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RECQLP46063 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RECQLP46063 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RECQLP46063 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RECQLP46063 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RECQLP46063 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RECQLP46063 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RECQLP46063 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RECQLP46063 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RECQLP46063 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RECQLP46063 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RECQLP46063 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RECQLP46063 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RECQLP46063 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RECQLP46063 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RECQLP46063 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RECQLP46063 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RECQLP46063 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RECQLP46063 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RECQLP46063 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RECQLP46063 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RECQLP46063 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RECQLP46063 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RECQLP46063 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RECQLP46063 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RECQLP46063 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RECQLP46063 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RECQLP46063 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RECQLP46063 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RECQLP46063 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RECQLP46063 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RECQLP46063 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RECQLP46063 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RECQLP46063 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RECQLP46063 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RECQLP46063 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RECQLP46063 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RECQLP46063 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RECQLP46063 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RECQLP46063 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RECQLP46063 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RECQLP46063 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RECQLP46063 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RECQLP46063 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RECQLP46063 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RECQLP46063 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RECQLP46063 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RECQLP46063 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RECQLP46063 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RECQLP46063 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RECQLP46063 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RECQLP46063 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RECQLP46063 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RECQLP46063 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RECQLP46063 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RECQLP46063 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RECQLP46063 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RECQLP46063 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RECQLP46063 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RECQLP46063 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RECQLP46063 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RECQLP46063 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RECQLP46063 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RECQLP46063 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms