Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCAMP43121 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCAMP43121 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCAMP43121 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCAMP43121 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCAMP43121 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCAMP43121 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MCAMP43121 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCAMP43121 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCAMP43121 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MCAMP43121 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCAMP43121 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCAMP43121 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCAMP43121 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCAMP43121 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCAMP43121 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCAMP43121 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCAMP43121 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCAMP43121 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCAMP43121 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCAMP43121 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCAMP43121 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCAMP43121 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCAMP43121 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCAMP43121 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCAMP43121 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCAMP43121 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCAMP43121 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCAMP43121 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCAMP43121 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MCAMP43121 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCAMP43121 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCAMP43121 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCAMP43121 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCAMP43121 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCAMP43121 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCAMP43121 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCAMP43121 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCAMP43121 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCAMP43121 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCAMP43121 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MCAMP43121 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MCAMP43121 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCAMP43121 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCAMP43121 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCAMP43121 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCAMP43121 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MCAMP43121 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCAMP43121 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCAMP43121 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCAMP43121 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCAMP43121 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCAMP43121 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCAMP43121 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCAMP43121 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCAMP43121 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCAMP43121 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCAMP43121 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCAMP43121 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCAMP43121 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCAMP43121 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCAMP43121 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCAMP43121 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCAMP43121 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCAMP43121 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCAMP43121 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCAMP43121 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCAMP43121 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCAMP43121 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MCAMP43121 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCAMP43121 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCAMP43121 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCAMP43121 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCAMP43121 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCAMP43121 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MCAMP43121 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCAMP43121 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCAMP43121 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCAMP43121 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCAMP43121 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MCAMP43121 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCAMP43121 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCAMP43121 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCAMP43121 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MCAMP43121 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCAMP43121 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCAMP43121 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCAMP43121 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCAMP43121 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCAMP43121 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCAMP43121 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCAMP43121 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCAMP43121 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCAMP43121 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCAMP43121 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCAMP43121 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCAMP43121 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCAMP43121 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCAMP43121 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCAMP43121 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms