Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms