Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTF4P34130 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF4P34130 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF4P34130 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF4P34130 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF4P34130 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF4P34130 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF4P34130 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF4P34130 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF4P34130 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF4P34130 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF4P34130 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF4P34130 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF4P34130 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF4P34130 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF4P34130 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF4P34130 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF4P34130 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF4P34130 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF4P34130 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF4P34130 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF4P34130 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF4P34130 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF4P34130 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF4P34130 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF4P34130 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF4P34130 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF4P34130 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF4P34130 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF4P34130 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF4P34130 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF4P34130 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF4P34130 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF4P34130 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF4P34130 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF4P34130 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF4P34130 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF4P34130 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF4P34130 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF4P34130 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF4P34130 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF4P34130 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF4P34130 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF4P34130 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTF4P34130 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTF4P34130 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTF4P34130 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTF4P34130 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTF4P34130 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTF4P34130 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTF4P34130 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NTF4P34130 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTF4P34130 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTF4P34130 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTF4P34130 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTF4P34130 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTF4P34130 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTF4P34130 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTF4P34130 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTF4P34130 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTF4P34130 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTF4P34130 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTF4P34130 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTF4P34130 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTF4P34130 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTF4P34130 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTF4P34130 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTF4P34130 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTF4P34130 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTF4P34130 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms