Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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CASQ1P31415 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
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CASQ1P31415 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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CASQ1P31415 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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CASQ1P31415 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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CASQ1P31415 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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