Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXC12P31275 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC12P31275 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC12P31275 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC12P31275 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC12P31275 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC12P31275 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXC12P31275 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC12P31275 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC12P31275 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC12P31275 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC12P31275 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC12P31275 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXC12P31275 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXC12P31275 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC12P31275 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC12P31275 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC12P31275 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXC12P31275 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC12P31275 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC12P31275 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC12P31275 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC12P31275 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXC12P31275 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXC12P31275 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC12P31275 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC12P31275 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC12P31275 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC12P31275 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC12P31275 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC12P31275 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC12P31275 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC12P31275 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC12P31275 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC12P31275 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC12P31275 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms