Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCAP28676 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCAP28676 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCAP28676 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GCAP28676 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCAP28676 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCAP28676 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCAP28676 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCAP28676 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCAP28676 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GCAP28676 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GCAP28676 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCAP28676 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCAP28676 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCAP28676 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCAP28676 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCAP28676 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCAP28676 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCAP28676 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCAP28676 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GCAP28676 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCAP28676 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCAP28676 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCAP28676 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCAP28676 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCAP28676 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCAP28676 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCAP28676 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCAP28676 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GCAP28676 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCAP28676 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCAP28676 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCAP28676 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCAP28676 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GCAP28676 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GCAP28676 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCAP28676 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCAP28676 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCAP28676 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCAP28676 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCAP28676 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GCAP28676 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GCAP28676 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCAP28676 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCAP28676 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCAP28676 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCAP28676 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCAP28676 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCAP28676 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCAP28676 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCAP28676 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCAP28676 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCAP28676 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCAP28676 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCAP28676 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCAP28676 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCAP28676 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCAP28676 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GCAP28676 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCAP28676 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCAP28676 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCAP28676 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCAP28676 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCAP28676 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCAP28676 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCAP28676 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCAP28676 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GCAP28676 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCAP28676 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCAP28676 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCAP28676 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCAP28676 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCAP28676 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCAP28676 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCAP28676 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCAP28676 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCAP28676 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCAP28676 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCAP28676 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GCAP28676 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
GCAP28676 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GCAP28676 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GCAP28676 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GCAP28676 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GCAP28676 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GCAP28676 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GCAP28676 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCAP28676 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCAP28676 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCAP28676 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCAP28676 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCAP28676 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCAP28676 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCAP28676 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCAP28676 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCAP28676 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCAP28676 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCAP28676 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GCAP28676 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GCAP28676 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms