Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PLNP26678 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PLNP26678 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PLNP26678 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PLNP26678 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PLNP26678 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PLNP26678 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PLNP26678 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PLNP26678 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PLNP26678 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PLNP26678 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PLNP26678 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PLNP26678 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PLNP26678 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PLNP26678 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PLNP26678 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PLNP26678 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PLNP26678 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PLNP26678 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PLNP26678 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PLNP26678 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PLNP26678 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PLNP26678 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PLNP26678 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PLNP26678 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PLNP26678 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PLNP26678 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PLNP26678 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PLNP26678 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PLNP26678 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PLNP26678 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PLNP26678 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PLNP26678 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PLNP26678 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PLNP26678 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PLNP26678 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PLNP26678 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PLNP26678 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PLNP26678 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PLNP26678 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PLNP26678 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PLNP26678 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PLNP26678 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PLNP26678 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PLNP26678 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PLNP26678 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PLNP26678 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PLNP26678 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PLNP26678 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PLNP26678 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PLNP26678 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PLNP26678 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PLNP26678 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PLNP26678 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PLNP26678 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PLNP26678 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PLNP26678 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PLNP26678 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PLNP26678 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PLNP26678 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PLNP26678 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PLNP26678 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PLNP26678 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PLNP26678 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PLNP26678 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PLNP26678 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PLNP26678 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PLNP26678 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PLNP26678 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PLNP26678 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PLNP26678 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PLNP26678 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PLNP26678 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PLNP26678 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PLNP26678 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PLNP26678 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PLNP26678 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PLNP26678 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PLNP26678 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PLNP26678 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PLNP26678 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PLNP26678 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PLNP26678 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PLNP26678 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PLNP26678 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PLNP26678 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PLNP26678 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PLNP26678 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PLNP26678 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PLNP26678 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PLNP26678 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PLNP26678 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PLNP26678 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PLNP26678 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PLNP26678 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PLNP26678 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PLNP26678 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PLNP26678 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PLNP26678 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PLNP26678 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms