Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms