Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSSP25774 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSSP25774 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSSP25774 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSSP25774 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSSP25774 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSSP25774 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSSP25774 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSSP25774 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSSP25774 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSSP25774 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSSP25774 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSSP25774 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSSP25774 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSSP25774 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSSP25774 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSSP25774 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSSP25774 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSSP25774 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSSP25774 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSSP25774 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSSP25774 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSSP25774 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSSP25774 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSSP25774 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSSP25774 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSSP25774 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSSP25774 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSSP25774 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSSP25774 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSSP25774 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSSP25774 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSSP25774 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSSP25774 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSSP25774 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSSP25774 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSSP25774 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSSP25774 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSSP25774 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSSP25774 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSSP25774 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSSP25774 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSSP25774 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSSP25774 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSSP25774 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSSP25774 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSSP25774 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSSP25774 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSSP25774 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSSP25774 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSSP25774 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSSP25774 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSSP25774 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSSP25774 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSSP25774 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSSP25774 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSSP25774 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSSP25774 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSSP25774 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSSP25774 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSSP25774 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSSP25774 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSSP25774 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSSP25774 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSSP25774 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSSP25774 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSSP25774 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSSP25774 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSSP25774 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSSP25774 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSSP25774 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSSP25774 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSSP25774 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSSP25774 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSSP25774 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSSP25774 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSSP25774 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSSP25774 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSSP25774 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSSP25774 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSSP25774 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSSP25774 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSSP25774 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSSP25774 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSSP25774 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSSP25774 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSSP25774 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSSP25774 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSSP25774 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSSP25774 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSSP25774 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSSP25774 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSSP25774 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSSP25774 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSSP25774 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSSP25774 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSSP25774 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSSP25774 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSSP25774 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSSP25774 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms