Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPREP23469 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPREP23469 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPREP23469 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPREP23469 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPREP23469 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPREP23469 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPREP23469 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPREP23469 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPREP23469 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPREP23469 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPREP23469 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPREP23469 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPREP23469 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPREP23469 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPREP23469 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPREP23469 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPREP23469 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPREP23469 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPREP23469 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPREP23469 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPREP23469 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPREP23469 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPREP23469 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPREP23469 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPREP23469 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPREP23469 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPREP23469 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPREP23469 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPREP23469 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPREP23469 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPREP23469 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPREP23469 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPREP23469 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPREP23469 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPREP23469 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPREP23469 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPREP23469 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPREP23469 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPREP23469 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPREP23469 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPREP23469 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPREP23469 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPREP23469 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPREP23469 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPREP23469 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPREP23469 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPREP23469 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPREP23469 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPREP23469 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPREP23469 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPREP23469 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPREP23469 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPREP23469 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPREP23469 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPREP23469 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPREP23469 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPREP23469 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPREP23469 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPREP23469 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPREP23469 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPREP23469 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPREP23469 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPREP23469 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPREP23469 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPREP23469 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPREP23469 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPREP23469 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPREP23469 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPREP23469 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPREP23469 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPREP23469 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPREP23469 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPREP23469 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPREP23469 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPREP23469 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPREP23469 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPREP23469 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPREP23469 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPREP23469 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPREP23469 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPREP23469 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPREP23469 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPREP23469 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPREP23469 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPREP23469 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPREP23469 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPREP23469 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPREP23469 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPREP23469 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPREP23469 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPREP23469 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPREP23469 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPREP23469 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPREP23469 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPREP23469 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPREP23469 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPREP23469 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPREP23469 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPREP23469 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms