Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NR4A1P22736 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NR4A1P22736 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NR4A1P22736 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NR4A1P22736 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NR4A1P22736 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NR4A1P22736 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NR4A1P22736 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NR4A1P22736 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NR4A1P22736 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NR4A1P22736 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NR4A1P22736 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NR4A1P22736 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NR4A1P22736 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NR4A1P22736 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NR4A1P22736 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NR4A1P22736 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NR4A1P22736 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NR4A1P22736 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NR4A1P22736 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NR4A1P22736 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NR4A1P22736 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NR4A1P22736 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NR4A1P22736 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NR4A1P22736 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NR4A1P22736 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NR4A1P22736 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NR4A1P22736 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NR4A1P22736 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NR4A1P22736 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms