Protein–RNA interactions for Protein: P22061

PCMT1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMT1P22061 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms