Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP4AP20648 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP4AP20648 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms