Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM21P19474 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM21P19474 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM21P19474 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM21P19474 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM21P19474 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM21P19474 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM21P19474 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM21P19474 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM21P19474 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM21P19474 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM21P19474 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM21P19474 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM21P19474 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms