Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH1P12830 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH1P12830 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH1P12830 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH1P12830 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH1P12830 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH1P12830 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH1P12830 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH1P12830 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH1P12830 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH1P12830 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH1P12830 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH1P12830 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH1P12830 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH1P12830 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDH1P12830 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDH1P12830 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDH1P12830 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDH1P12830 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDH1P12830 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDH1P12830 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CDH1P12830 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDH1P12830 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDH1P12830 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDH1P12830 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDH1P12830 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDH1P12830 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CDH1P12830 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDH1P12830 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDH1P12830 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDH1P12830 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDH1P12830 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDH1P12830 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDH1P12830 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDH1P12830 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDH1P12830 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDH1P12830 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDH1P12830 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDH1P12830 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDH1P12830 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDH1P12830 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDH1P12830 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDH1P12830 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDH1P12830 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDH1P12830 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDH1P12830 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDH1P12830 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDH1P12830 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDH1P12830 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH1P12830 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH1P12830 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH1P12830 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH1P12830 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH1P12830 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH1P12830 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH1P12830 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH1P12830 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH1P12830 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH1P12830 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH1P12830 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH1P12830 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH1P12830 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH1P12830 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH1P12830 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH1P12830 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH1P12830 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH1P12830 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH1P12830 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH1P12830 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH1P12830 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH1P12830 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH1P12830 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH1P12830 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH1P12830 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH1P12830 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH1P12830 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH1P12830 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH1P12830 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH1P12830 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH1P12830 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH1P12830 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH1P12830 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH1P12830 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH1P12830 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDH1P12830 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH1P12830 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH1P12830 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH1P12830 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH1P12830 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH1P12830 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH1P12830 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH1P12830 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH1P12830 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH1P12830 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH1P12830 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH1P12830 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH1P12830 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH1P12830 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH1P12830 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH1P12830 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms