Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms