Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms