Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3P10147 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3P10147 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3P10147 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3P10147 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3P10147 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3P10147 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3P10147 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3P10147 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3P10147 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3P10147 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3P10147 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3P10147 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3P10147 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3P10147 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3P10147 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3P10147 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3P10147 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3P10147 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3P10147 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3P10147 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3P10147 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3P10147 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3P10147 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3P10147 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3P10147 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3P10147 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3P10147 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3P10147 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3P10147 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3P10147 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3P10147 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3P10147 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3P10147 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3P10147 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3P10147 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3P10147 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3P10147 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3P10147 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3P10147 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3P10147 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3P10147 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3P10147 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3P10147 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3P10147 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3P10147 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3P10147 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3P10147 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3P10147 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3P10147 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3P10147 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3P10147 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3P10147 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3P10147 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3P10147 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3P10147 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3P10147 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3P10147 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3P10147 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3P10147 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3P10147 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3P10147 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3P10147 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3P10147 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3P10147 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3P10147 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3P10147 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3P10147 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3P10147 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3P10147 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3P10147 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3P10147 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3P10147 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3P10147 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3P10147 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3P10147 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3P10147 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3P10147 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3P10147 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3P10147 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3P10147 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3P10147 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3P10147 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3P10147 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3P10147 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3P10147 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3P10147 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3P10147 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3P10147 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3P10147 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3P10147 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3P10147 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3P10147 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3P10147 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3P10147 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3P10147 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3P10147 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3P10147 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3P10147 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3P10147 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms