Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGB3P05106 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms