Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC1P02654 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC1P02654 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC1P02654 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC1P02654 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC1P02654 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC1P02654 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOC1P02654 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOC1P02654 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOC1P02654 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC1P02654 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC1P02654 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOC1P02654 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC1P02654 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC1P02654 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOC1P02654 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC1P02654 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC1P02654 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC1P02654 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC1P02654 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC1P02654 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC1P02654 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC1P02654 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC1P02654 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC1P02654 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC1P02654 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC1P02654 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC1P02654 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC1P02654 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC1P02654 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC1P02654 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC1P02654 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOC1P02654 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC1P02654 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC1P02654 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC1P02654 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC1P02654 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC1P02654 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC1P02654 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC1P02654 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC1P02654 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOC1P02654 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC1P02654 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APOC1P02654 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APOC1P02654 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APOC1P02654 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
APOC1P02654 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
APOC1P02654 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APOC1P02654 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms