Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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