Protein–RNA interactions for Protein: O95076

ALX3, Homeobox protein aristaless-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX3O95076 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALX3O95076 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALX3O95076 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALX3O95076 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALX3O95076 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALX3O95076 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALX3O95076 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ALX3O95076 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ALX3O95076 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ALX3O95076 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALX3O95076 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ALX3O95076 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALX3O95076 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ALX3O95076 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ALX3O95076 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ALX3O95076 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALX3O95076 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALX3O95076 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ALX3O95076 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALX3O95076 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALX3O95076 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALX3O95076 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALX3O95076 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALX3O95076 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ALX3O95076 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALX3O95076 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALX3O95076 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALX3O95076 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALX3O95076 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ALX3O95076 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ALX3O95076 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALX3O95076 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ALX3O95076 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ALX3O95076 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALX3O95076 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ALX3O95076 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ALX3O95076 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ALX3O95076 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ALX3O95076 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ALX3O95076 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ALX3O95076 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ALX3O95076 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ALX3O95076 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ALX3O95076 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALX3O95076 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALX3O95076 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALX3O95076 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ALX3O95076 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ALX3O95076 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALX3O95076 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ALX3O95076 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALX3O95076 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALX3O95076 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALX3O95076 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALX3O95076 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ALX3O95076 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALX3O95076 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ALX3O95076 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ALX3O95076 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALX3O95076 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALX3O95076 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALX3O95076 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALX3O95076 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALX3O95076 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALX3O95076 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALX3O95076 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALX3O95076 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALX3O95076 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALX3O95076 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALX3O95076 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ALX3O95076 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ALX3O95076 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALX3O95076 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALX3O95076 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALX3O95076 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALX3O95076 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ALX3O95076 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ALX3O95076 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALX3O95076 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ALX3O95076 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ALX3O95076 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALX3O95076 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ALX3O95076 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ALX3O95076 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ALX3O95076 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ALX3O95076 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALX3O95076 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ALX3O95076 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ALX3O95076 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ALX3O95076 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ALX3O95076 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ALX3O95076 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ALX3O95076 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ALX3O95076 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ALX3O95076 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALX3O95076 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALX3O95076 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALX3O95076 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ALX3O95076 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ALX3O95076 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms