Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SPAG9O60271 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPAG9O60271 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPAG9O60271 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPAG9O60271 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPAG9O60271 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPAG9O60271 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPAG9O60271 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPAG9O60271 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPAG9O60271 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPAG9O60271 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPAG9O60271 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPAG9O60271 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPAG9O60271 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPAG9O60271 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPAG9O60271 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPAG9O60271 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPAG9O60271 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPAG9O60271 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPAG9O60271 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPAG9O60271 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPAG9O60271 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPAG9O60271 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPAG9O60271 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPAG9O60271 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SPAG9O60271 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SPAG9O60271 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPAG9O60271 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SPAG9O60271 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPAG9O60271 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPAG9O60271 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPAG9O60271 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPAG9O60271 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SPAG9O60271 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPAG9O60271 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPAG9O60271 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPAG9O60271 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPAG9O60271 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPAG9O60271 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPAG9O60271 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPAG9O60271 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPAG9O60271 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPAG9O60271 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPAG9O60271 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPAG9O60271 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPAG9O60271 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPAG9O60271 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPAG9O60271 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
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