Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
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