Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KDELR3O43731 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KDELR3O43731 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KDELR3O43731 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KDELR3O43731 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KDELR3O43731 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KDELR3O43731 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KDELR3O43731 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KDELR3O43731 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KDELR3O43731 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KDELR3O43731 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KDELR3O43731 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KDELR3O43731 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KDELR3O43731 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KDELR3O43731 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KDELR3O43731 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KDELR3O43731 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KDELR3O43731 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KDELR3O43731 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms