Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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