Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TO15178 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TO15178 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TO15178 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TO15178 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TO15178 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TO15178 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TO15178 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TO15178 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TO15178 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TO15178 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TO15178 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TO15178 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TO15178 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TO15178 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TO15178 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TO15178 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TO15178 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TO15178 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TO15178 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TO15178 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TO15178 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TO15178 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TO15178 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TO15178 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TO15178 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TO15178 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TO15178 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TO15178 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TO15178 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TO15178 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TO15178 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TO15178 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TO15178 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TO15178 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TO15178 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TO15178 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TO15178 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TO15178 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TO15178 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TO15178 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TO15178 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TO15178 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TO15178 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TO15178 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TO15178 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TO15178 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TO15178 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TO15178 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TO15178 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TO15178 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TO15178 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TO15178 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TO15178 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TO15178 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TO15178 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TO15178 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TO15178 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TO15178 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TO15178 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TO15178 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TO15178 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TO15178 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TO15178 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TO15178 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TO15178 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TO15178 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TO15178 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TO15178 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TO15178 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TO15178 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TO15178 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TO15178 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TO15178 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TO15178 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TO15178 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TO15178 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TO15178 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TO15178 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TO15178 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TO15178 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TO15178 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TO15178 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TO15178 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TO15178 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TO15178 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TO15178 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TO15178 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TO15178 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TO15178 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TO15178 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TO15178 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TO15178 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TO15178 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TO15178 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TO15178 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TO15178 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TO15178 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TO15178 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TO15178 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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