Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms