Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms