Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms