Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms