Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms