Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms