Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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