Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GMNCA6NCL1 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GMNCA6NCL1 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GMNCA6NCL1 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GMNCA6NCL1 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GMNCA6NCL1 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GMNCA6NCL1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GMNCA6NCL1 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GMNCA6NCL1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GMNCA6NCL1 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GMNCA6NCL1 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GMNCA6NCL1 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GMNCA6NCL1 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GMNCA6NCL1 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GMNCA6NCL1 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GMNCA6NCL1 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GMNCA6NCL1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GMNCA6NCL1 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GMNCA6NCL1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GMNCA6NCL1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GMNCA6NCL1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GMNCA6NCL1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GMNCA6NCL1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GMNCA6NCL1 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GMNCA6NCL1 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GMNCA6NCL1 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GMNCA6NCL1 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms