Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PSDA5PKW4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms